研究主要围绕鸡、猪重要经济性状的遗传规律和分子机制而展开，在鸡、猪 QTL 定位、主效基因检测、重要基因位置克隆等方面做了大量研究工作。重点开展定位、分离和分析影响畜禽重要经济性状的功能基因或基因网络，研究动物复杂性状形成的遗传机制，发展分子育种理论和技术途径并应用于全基因组选择育种研究，以改良提高我国畜禽生产能力。